A. lefiniense est étroitement apparenté aux phénotypes rouges dans la sous-espèce Aphyosemion (Myers, 1924): A. elegans (Boulenger, 1999), A. cognatum (Meinken, 1951), A. rectogoense (Radda & Huber, 1977). et A. schioetzi (Huber & Scheel, 1981).
A. lefiniense diffère très légèrement de ces espèces proches dans les données méristiques et morphométriques, mais de façon remarquable, dans la couleur du patron des nageoires caudale et dorsale, présentant. du jaune au lieu de rouge, sur les bords extérieurs.
Description du mâle:
La couleur de base est brune, plus foncée sur le dos, plus claire, presque brun jaune sur la partie postérieure du corps, le ventre étant plus clair, presque blanc. Sur les côtés de la tête, sur la partie antérieure du corps, les écailles scintillent d'un vert plus ou moins soutenu, variable avec l'éclairage. Sur la tête, derrière les yeux, sur les opercules, se trouvent trois bandes rouges, inclinées et irrégulières. Plus bas, au dessous de l'œil, se trouvent deux taches rouges, une bande rouge souligne la lèvre inférieure. La gorge présente des points rouges irréguliers et, sur l'opercule, sur le côté de la tête, des bandes marginales rouges. Sur la longueur du corps courent cinq rangées de points rouges. Sur la partie antérieure et sur les côtés du ventre, leurs disposition est moins régulière. Ces points sont ronds sur la partie antérieure du corps, de ovale à une forme en demi-lune sur les parties postérieures et dorsale. Ils dessinent sur toute la partie postérieure du corps, une sorte de filet renforcé par les rangées d'écailles plus sombres. La base de la nageoire dorsale est brunâtre ourlée de jaune clair, elle présente des points rouges isolés entre les rayons. Sur la partie extérieure, ces points rouges forment une bande irrégulière et, chez certain sujet, cette bande est très large.
La nageoire anale est jaunâtre avec un ourlet jaune intense. A la base, elle présente des points rouges mais certains Poissons présentent aussi une large bande submarginale rouge soutenu. La couleur de la caudale est identique. La partie centrale jaunâtre à brun verdâtre porte sur les liserés haut et bas un ourlet jaune clair. Au centre se trouvent des points rouges. Certains Poissons présentent en plus une étroite bande marginale, haute et basse, rouge soutenu. Les ventrales sont jaunes avec des traits, des taches ou des points rouges. Les pectorales sont jaunâtre, translucides, ourlées de jaune avec une bande submarginale en rangées de points et traits.
Description de la femelle : Les femelles ne présentent pas la même richesse de couleurs. Elles sont plus simplement brune avec cinq rangées de petits points rougeâtres et seulement des petits points rouges à la base des nageoires impaires, translucides et incolores.
